Haplotyping Methods for Pedigrees
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Conditional probability methods for haplotyping in pedigrees.
Efficient haplotyping in pedigrees is important for the fine mapping of quantitative trait locus (QTL) or complex disease genes. To reconstruct haplotypes efficiently for a large pedigree with a large number of linked loci, two algorithms based on conditional probabilities and likelihood computations are presented. The first algorithm (the conditional probability method) produces a single, appr...
متن کاملMinimum-recombinant haplotyping in pedigrees.
This article presents a six-rule algorithm for the reconstruction of multiple minimum-recombinant haplotype configurations in pedigrees. The algorithm has three major features: First, it allows exhaustive search of all possible haplotype configurations under the criterion that there are minimum recombinants between markers. Second, its computational requirement is on the order of O(J(2)L(3)) in...
متن کاملMaximum likelihood haplotyping for general pedigrees.
Haplotype data is valuable in mapping disease-susceptibility genes in the study of Mendelian and complex diseases. We present algorithms for inferring a most likely haplotype configuration for general pedigrees, implemented in the newest version of the genetic linkage analysis system SUPERLINK. In SUPERLINK, genetic linkage analysis problems are represented internally using Bayesian networks. T...
متن کاملislanding detection methods for microgrids
امروزه استفاده از منابع انرژی پراکنده کاربرد وسیعی یافته است . اگر چه این منابع بسیاری از مشکلات شبکه را حل می کنند اما زیاد شدن آنها مسائل فراوانی برای سیستم قدرت به همراه دارد . استفاده از میکروشبکه راه حلی است که علاوه بر استفاده از مزایای منابع انرژی پراکنده برخی از مشکلات ایجاد شده توسط آنها را نیز منتفی می کند . همچنین میکروشبکه ها کیفیت برق و قابلیت اطمینان تامین انرژی مشترکان را افزایش ...
15 صفحه اولEfficient haplotyping for families
Hapi is a novel dynamic programming algorithm for haplotyping nuclear families that outperforms contemporary family-based haplotyping algorithms. Haplotypes are useful for mapping and identifying genes which cause and contribute to the etiology of human disease, and for analyzing the products of meiosis to locate recombinations, enabling the identification of recombination hotspots and gene con...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Human Heredity
سال: 2009
ISSN: 1423-0062,0001-5652
DOI: 10.1159/000194978